Canu使用教程

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Canu

用于组装PacBio和Nanopore两家公司得到的测序结果

1.canu的使用

(1) 参考语法

canu -p a -d test -pacbio pacbio.fasta genomeSize=5m

(2) 参数解释

-p 输出文件前缀
-d 输出目录名
-pacbio 需要组装的文件的测序类型
genomeSize 基因组大小的估计值